Одобряването  от НОИ на болничния, подаден по интернет отнема време, а при грешна информация не може веднага да бъде приет, признаха лични лекари. Освен това системата приема информацията твърде бавно. Това създаде известен хаос и забавяне на пациентите в лекарските кабинети, което доведе и до повече опашки първите работни дни от новата година.

Е-болничният лист влезе в сила от началото на 2015 година, но реалното му приложение стартира с първите работни дни. Според новите правила лекарите, зъболекарите и лечебните заведения ще подават онлайн информация до НОИ за издадените болнични. На пациентите ще се дава хартиено копие, но то ще служи като извинителна бележка пред работодателя. Очаква се новата процедура ще съкрати времето за изплащане на обезщетенията за болнични.

Пациенти и лекари алармират, че системата е въведена без гратисен период, в който да важат старите хартиени бланки. Повечето джипита все още не са инсталирали необходимата компютърна програма.
За промяната се знаеше още в началото на миналата година. На 19 декември НОИ публикува безплатния софтуер за издаване на болнични листове и решения по обжалването им. Чрез него се извършва въвеждане, контрол, съхраняване, представяне/анулиране на данните и изготвяне на справки за издадени/анулирани болнични листове, както и на данните от решения на лекарските комисии по повод на обжалвани болнични листове. Въведените данни се изпращат в НОИ и постъпват в Електронния регистър на болничните листове едновременно с издаването им или чрез експорт на файлове, които се подават в последствие също чрез продукта или през уеб-приложението в сайта на НОИ.

Въпреки трудностите до сряда на обяд в НОИ са заведени по електронен път 17 000 болнични, а 4000 лечебни заведения са получили регистрация и достъп до сървърите на НОИ.

Най-трудно се оказва за личните лекари, които имат срок от 6 месеца да усвоят програмата, иначе ще трябва да спрат да издават болнични.